460 470 480 490 ----:----|----:----|----:----|----:----|----: Consensus qvxvxexxxxxsxxniVVIdSvxalxxxxyxxxxxgexnxxxqxx =============================================================================== PYROCOCCUS_FURIOSUS arpdaffgdptrpigghILahsa---------------------- Pyrococcus_abyssi arpdaffgdptrpigghILahsa---------------------- =============================================================================== METHANOCOCCUS_VOLTAE tnqVsakpdaffgmaeqaIgghivghaa----------------- Methanococcus_jannaschii tnqVaarpdalfgpSeqaIgghivghaa----------------- =============================================================================== SULFOLOBUS_SOLFATARICUS QVmarpdmfygdptvaVgghTLyhVp------------------- Aeropyrum_pernix QVmarpdvfygdptqaVgghvLghap------------------- Desulfurococcus_amylolyticus QVmarpdvfygdpttaVgghvLahtp------------------- Sulfolobus_tokodaii QVmarpdmfygdptvaVgghTLyhVp------------------- =============================================================================== HUMAN aM-MvE-----SryaLLIVDSatALyrtdYsgr--GElS--aRqm YEAST QM-MsE-----SrfSLIVVDSVmALyrtdFsgr--GElS--aRqm Apis_mellifera aM-MtE-----SryaLLIVDSatgLyrteYsgr--GEla--aRqm Aspergillus_fumigatus QM-McE-----TrfSLLVVDSatsLyrtdFngr--GElS--sRqt Bombyx_mandarina aM-MaE-----SrySLIIVDSatALyrtdYsgr--GElN--sRql Bos_taurus aM-MvE-----SryaLLIVDSatALyrtdYsgr--GElS--aRqm Caenorhabditis_elegans aM-MsE-----SryaVVIVDcatAhfrneYtgr--GDla--eRqm Candida_albicans EM-MaE-----SrfSLLIVDSImsLyrtdYagr--GElS--aRqt Candida_glabrata QM-MsE-----SrfSLIVVDSVmALyrtdFsgr--GElS--aRqm Canis_lupus aM-MvE-----SryaLLIVDSatALyrtdYsgr--GElS--aRqm Coprinus_cinereus aL-MsE-----SrfcLLIVDSctALyrtdFsgr--GElS--sRqt Cricetulus_griseus aM-MvE-----SryaLLIVDSatALyrtdYsgr--GElS--aRqm Cryptococcus_neoformans aM-MaE-----SrfSLLIVDSctsLyrtdFsgr--GElS--aRqm Danio_rerio aM-MtE-----SryaLLIVDSatALyrtdYsgr--GElS--aRqg Debaryomyces_hansenii QM-MsE-----SrfScLIVDSImsLyrtdYsgr--aElS--aRqt Drosophila_melanogaster gM-LfE-----SryaLLIVDSamALyrsdYigr--GEla--aRqn Drosophila_pseudoobscura gM-LfE-----TryaaVIVDSVmALyrsdYigr--GEla--aRqn Emericella_nidulans QM-McE-----TrfSLLVVDSatsLyrtdFngr--GElS--tRqt Encephalitozoon_cuniculi aM-MsE-----SkySVLIIDSatALyrtdFsgr--GElg--aRql Eremothecium_gossypii QM-MsE-----SrfSLIVVDSImALyrtdFsgr--GElS--aRqm Gallus_gallus aM-MaE-----SryaLLIVDSatALyrtdYsgr--GElS--aRqm Gibberella_zeae aM-McE-----TrfSLLIVDSatsLyrtdFcgr--GElS--nRqt Kluyveromyces_lactis QM-MsE-----SrfSLIIVDSImALyrtdFsgr--GElS--aRqm Mus_musculus aM-MvE-----SryaLLIVDSatALyrtdYsgr--GElS--aRqm Neurospora_crassa aM-McE-----TrfSLLIVDSatsLyrtdFlgr--GElS--sRqt Nosema_bombycis sL-MsQ-----NkyaVLIIDSatALyrtdFsgr--GElg--aRqi Oikopleura_dioica aM-MtE-----SrySIMIVDSImALyrsdYsgr--GEla--aRqm Oryctolagus_cuniculus aM-MvE-----SryaLLIVDSatALyrtdYsgr--GElS--aRqm Pichia_angusta sM-MtE-----SrfSLLIVDSImALyrtdYsgr--GElS--aRqm Pleurotus_ostreatus RL-MsE-----SrfcLLIVDSctALyrtdFsgr--GElS--sRqn Rattus_norvegicus aM-MvE-----SryaLLIVDSatALyrtdYsgr--GElS--aRqm Schizosaccharomyces_pombe nM-MsE-----SrfSLLVVDSctALyrtdFsgr--GElS--aRqm Strongylocentrotus_purpuratus aM-MaE-----SryaLLIVDSatALyrtdYsgr--GEla--sRqm Tetraodon_nigroviridis aM-MaE-----SryaLLIVDSatALyrtdYsgrvwrrcg--dnqs Ustilago_maydis aM-MaE-----SrfSLLIVDSLtsLyrtdFsgr--GElS--aRqm Xenopus_laevis aM-MaE-----SryaLLIVDSatALyrtdYsgr--GElS--aRqm Xenopus_tropicalis aM-MaE-----SryaLLIVDSatALyrtdYsgr--GElS--aRqm Yarrowia_lipolytica nM-MtK-----SrfScLIVDSImALyrtdYagr--GElS--aRqt Cryptosporidium_spp aM-MtE-----SrfaLMIVDSatALyrseYngr--GEla--tRqs Dictyostelium_discoideum aM-MsE-----SryaLLIVDSatALyrtdYagr--GEla--dRqk Entamoeba_histolytica gL-MaK-----erygLLIIDSatALyrtdYsgr--GEla--sRqm Leishmania_donovani aM-MaE-----NrfaLIIVDSatALyrtdYsgr--nEla--aRqm Leishmania_tropica aM-MaE-----NrfaLIIVDSatALyrtdYsgr--nEla--aRqm Plasmodium_berghei aM-MaD-----TrfaLLIVDSatALyrseYtgr--GEla--nRqs Plasmodium_falciparum aM-MaD-----arfaLLIVDSatALyrseYigr--GEla--nRqs Plasmodium_yoelii aM-MaD-----TrfaLLIVDSatALyrseYtgr--GEla--nRqs Tetrahymena_thermophila aL-MaE-----SkyaLLIVDSatALyrtdYsgr--GElS--vRqn Theileria_annulata aM-MaQ-----TrfaLLIVDSatsLyrsdYsgr--GEla--sRqm Theileria_parva aM-MaQ-----TrfaLLIVDSatsLyrsdYsgr--GEla--sRqm Trypanosoma_brucei at-MaE-----hrvaIIVVDSatALyrtdYngr--GEla--aRqm Trypanosoma_cruzi aM-MaE-----NrfaIIIVDSatALyrtdYsgr--nEla--aRqm Arabidopsis_thaliana sM-MiE-----TrfaLLIVDSatALyrtdFsgr--GElS--aRqm Oryza_sativa sM-MiE-----TrfaLMIVDSatALyrtdFsgr--GElS--aRqm Zea_mays sM-MvE-----TrfaLMVVDSatALyrtdFsgr--GElS--aRqm =============================================================================== ECOLI R--sg------a-vDVIVVDSVaALtpkaeiegeiGDsHmglaar MYCOBACTERIUM_SMEGMATIS R--sg------a-lDIIVIDSVaALvpraeiegemGDsHvglQar MYCOBACTERIUM_TUBERCULOSIS R--sg------a-lDIVLIDSVaALvpraelegemGDsHvglQar Acetobacter_polyoxogenes R--sg------a-vDVLVVDSVaALvpraelegdmGDsHvglhar Acinetobacter_calcoaceticus R--sg------a-iDLIVVDSVaALtpkaeiegemGDsHmglQar Actinobacillus_pleuropneumoniae R--sg------a-vDVIIVDSVaALtpkaeiegdmGDsHmglQar Actinobacillus_succinogenes R--sg------a-iDVIIVDSVaALtpkaeiegdmGDaHvglQar Bacillus_licheniformis R--sg------a-vDIVVIDSVaALvpkaeiegdmGDsHvglQar Bacillus_subtilis R--sg------a-vDIVVVDSVaALvpkaeiegdmGDsHvglQar Burkholderia_fungorum R--sg------S-iDMIVIDSVaALvpkaeiegemGDslpglQar Carboxydothermus_hydrogenoformans R--sg------a-iDVIVIDSVaALvpraeiegemGDaHvglQar Chromobacterium_violaceum R--ss------g-vDVIVVDSVaALvpkaeiegemGDsHvglQar Clostridium_thermocellum R--sg------a-iDVIVIDSVaALvpkaeidgemGDsHvglQar Colwellia_psychrerythraea R--sg------a-iDVIVVDSVaALtpkaeiegdmGDsHmglQar Desulfotalea_psychrophila R--sg------g-vDIIVVDSVaALtpkaeidgnvGDvHvglQar Enterococcus_faecalis s--sg------a-iDIVVIDSVaALvpraeidgemGasHvglQar Erwinia_carotovora R--sg------a-vDVIIVDSVaALtpkaeiegeiGDsHmglaar Haemophilus_ducreyi R--sg------a-vDVIIVDSVaALtpkaeiegdmGDsymglQar Haemophilus_influenzae R--sg------a-iDVIIVDSVaALtpkaeiegdmGDsHmglQar Histophilus_somni R--sg------a-vDVVIVDSVaALtpkaeiegemGDtHvglQar Kineococcus_radiotolerans R--sg------a-lDIIVIDSVaALvpkaeiegemGDsHvglQar Leifsonia_xyli R--sg------S-iDLIVIDSVaALvpraeiegemGDaHvglQar Listeria_monocytogenes R--sg------a-vDMLVIDSVaALvpraeiegemGDaHvglQar Mannheimia_succiniciproducens R--sg------a-vDVIIVDSVaALtpkaeiegdmGDsHvglQar Neisseria_gonorrhoeae R--sg------g-iDMVVVDSVaALvpkaeiegdmGDsHvglQar Nitrosomonas_europaea R--sg------S-vDVVVVDSVaALtpraeiegemGEpqmglQar Nitrosomonas_eutropha R--sg------S-vDIVVIDSVaALtpraeiegemGEpqmglQar Oceanobacillus_iheyensis R--sg------a-vDIIVVDSVaALvpkaeiegemGDsHvglQar Pasteurella_multocida R--sg------a-iDVMVVDSVaALtpkaeiegemGDsHmglQar Photobacterium_profundum R--sg------a-vDLIVVDSVaALtpkaeiegemGDsHmglQar Photorhabdus_luminescens R--sg------a-vDVIIVDSVaALtpkaeiegeiGDsHmglaar Proteus_mirabilis R--sg------a-vDVIVVDSVaALtpkaeiegeiGDsHvglaar Pseudomonas_aeruginosa R--sg------a-vNLIVVDSVaALvpkaeiegeiGDsHvglaar Pseudomonas_cepacia R--sg------S-iDMIVIDSVaALvpkaeiegemGDslpglQar Salmonella_typhi R--sg------a-vDVIVVDSVaALtpkaeiegeiGDsHmglaar Shewanella_putrefaciens R--sg------a-vDVIVVDSVaALtpkaeiegeiGDsHmglaar Streptomyces_avermitilis R--sg------a-lDLIVIDSVaALvpraeiegemGDsHvglQar Streptomyces_coelicolor R--sg------a-lDLIVIDSVaALvpraeiegemGDsHvglQar Streptomyces_lividans R--sg------a-lDLIVIDSVaALvpraeiegemGDsHvglQar Vibrio_cholerae R--sg------a-vDVIVVDSVaALtpkaeiegemGDsHmglQar Vibrio_splendidus R--sg------a-iDVLVIDSVaALtpkaeiegemGDsHmglQar Vibrio_vulnificus R--sg------a-vDVIVVDSVaALtpkaeiegemGDsHmglQar Xanthomonas_vasicola R--ss------S-vDIVVIDSVaALtpkaeiegemGDqlpglQar Xylella_fastidiosa R--sg------S-iDIMVIDSVaALtpraeiegemGDqlpglQar Yersinia_pestis R--sg------a-vDVIIVDSVaALtpkaeiegeiGDsHmglaar =============================================================================== DEINOCOCCUS_RADIODURANS aIfInQvrekigvmygnpetTtggralkfYa-------------- Deinococcus_geothermalis aIfInQvrekigvmygnpetTtggralkfYa-------------- Thermus_aquaticus aIfInQvrekvgvmygnpetTpggralkfYs-------------- =============================================================================== Consensus qvxvxexxxxxsxxniVVIdSvxalxxxxyxxxxxgexnxxxqxx