Rad51/RadA/RecA

                                    140       150       160       170       180
                                  ----|----:----|----:----|----:----|----:----|
Consensus                         xdqexxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
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PYROCOCCUS_FURIOSUS               l--------r--e---ag---y-----------------dtleai
Pyrococcus_abyssi                 l--------r--e---ag---f-----------------dtleai
===============================================================================
METHANOCOCCUS_VOLTAE              ---lve------a----g--yi--d--------------------
Methanococcus_jannaschii          ---lke------a----g--yt--d--------------------
===============================================================================
SULFOLOBUS_SOLFATARICUS           -vin------k----l--ie---a-----------------gyss
Aeropyrum_pernix                  -taQ------k----l--me---a-----------------gytt
Desulfurococcus_amylolyticus      -iaD------k----l--ea---a-----------------gyls
Sulfolobus_tokodaii               -iln------k----l--ie---a-----------------gyss
===============================================================================
HUMAN                             mqmQlean---a------------dts------v-----------
YEAST                             lqEQaeaq---geme---------dea------y-----------
Apis_mellifera                    mastaslq---gdee---------fee------y-----------
Aspergillus_fumigatus             aDlEtqne---y------------des------g-----------
Bombyx_mandarina                  nttasatt---t------------svd------e-----------
Bos_taurus                        ---------------------------------------------
Caenorhabditis_elegans            dqallnaa---i------------edn------a-----------
Candida_albicans                  hpQninad---a------------eve------a-----------
Candida_glabrata                  lfhQeqye---egme------------------------------
Canis_lupus                       mqmQlean---a------------dts------v-----------
Coprinus_cinereus                 qgyDgsqi---p------------egd------e-----------
Cricetulus_griseus                mqmQlean---a------------dts------v-----------
Cryptococcus_neoformans           vNQhge------eae---------eed------f-----------
Danio_rerio                       -amrnasr---veve---------aev------e-----------
Debaryomyces_hansenii             gaQtnehe---a------------smg------d-----------
Drosophila_melanogaster           -EKltnvq---aqqe---------eee------------------
Drosophila_pseudoobscura          ------da---l------------tns------v-----------
Emericella_nidulans               aDmEtqne---f------------dds------g-----------
Encephalitozoon_cuniculi          eEyQyq------------------dte------y-----------
Eremothecium_gossypii             iEvhaesg---r------------gqg------y-----------
Gallus_gallus                     mqvQfeas---t------------dts------a-----------
Gibberella_zeae                   qEhDesqm---g------------eeg------g-----------
Kluyveromyces_lactis              vqQriqet---dfma---------ee-------------------
Mus_musculus                      mqmQleas---a------------dts------v-----------
Neurospora_crassa                 eEyDesanm--e------------dds------g-----------
Nosema_bombycis                   -----------s------------kqa------f-----------
Oikopleura_dioica                 saEhneag---t------------sen------t-----------
Oryctolagus_cuniculus             mqmQlean---a------------dts------v-----------
Pichia_angusta                    gEQElsag---y------------hes------mvaedd------
Pleurotus_ostreatus               --sQasqd---ldeg---------des------y-----------
Rattus_norvegicus                 mqmQlean---a------------dts------v-----------
Schizosaccharomyces_pombe         sNyEydvn---v------------qde------e-----------
Strongylocentrotus_purpuratus     mqmh---n---a------------eqe------v-----------
Tetraodon_nigroviridis            maaEvrgq---a------------eve------------------
Ustilago_maydis                   qNaQdpaq---i------------ged------d-----------
Xenopus_laevis                    mqahyeae---a---------------------t-----------
Xenopus_tropicalis                mqahyeae---a---------------------t-----------
Yarrowia_lipolytica               --------------------------a------d-----------
Cryptosporidium_spp               nEivnenn---e------------nqn------n-----------
Dictyostelium_discoideum          eEvDiene---q------------qqe------e-----------
Entamoeba_histolytica             vNEEehee---e------------eee------e-----------
Leishmania_donovani               pqQpqqqq---s------------tdm------a-----------
Leishmania_tropica                pqQQqqqq---s------------tdm------a-----------
Plasmodium_berghei                kEdtisqt---c------------dns------t-----------
Plasmodium_falciparum             kisnssti---deie---------eeq------l-----------
Plasmodium_yoelii                 isQtcdns---t------------ted------v-----------
Tetrahymena_thermophila           ------ae---y------------aed------v-----------
Theileria_annulata                lslvkeen---s------------mgv------s-----------
Theileria_parva                   lslvkeen---s------------mgv------s-----------
Trypanosoma_brucei                dDaavdav---n------------dntqemqqqv-----------
Trypanosoma_cruzi                 eqQQqqqe---d------------qqn------v-----------
Arabidopsis_thaliana              tmEQrrnq---navq---------qqd------d-----------
Oryza_sativa                      tsaaaaaa---a------------eqq------q-----------
Zea_mays                          asaQqzaa---aaie---------ze-------------------
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ECOLI                             eNKQkala---a------------alg------q-----------
MYCOBACTERIUM_SMEGMATIS           pDREkale---l------------ama------q-----------
MYCOBACTERIUM_TUBERCULOSIS        pDREkale---l------------ama------q-----------
Acetobacter_polyoxogenes          iDKskale---g------------als------q-----------
Acinetobacter_calcoaceticus       dNKskalq---a------------als------q-----------
Actinobacillus_pleuropneumoniae   eqKEkala---a------------ala------q-----------
Actinobacillus_succinogenes       eEKskala---a------------alg------q-----------
Bacillus_licheniformis            sDRQaald---m------------alk------q-----------
Bacillus_subtilis                 sDRQaald---m------------alk------q-----------
Burkholderia_fungorum             aEKskala---a------------ala------q-----------
Carboxydothermus_hydrogenoformans nDKlkale---l------------tis------q-----------
Chromobacterium_violaceum         eDKskala---a------------ala------q-----------
Clostridium_thermocellum          iEKKkale---m------------vlg------q-----------
Colwellia_psychrerythraea         dDKEkals---a------------ala------q-----------
Desulfotalea_psychrophila         kDKagsve---n------------ais------q-----------
Enterococcus_faecalis             dDRKvald---a------------alk------k-----------
Erwinia_carotovora                eNKQkala---a------------alg------q-----------
Haemophilus_ducreyi               eqKEkala---a------------ala------q-----------
Haemophilus_influenzae            eEKQkala---a------------alg------q-----------
Histophilus_somni                 eEKakale---a------------alg------q-----------
Kineococcus_radiotolerans         aDREkald---a------------ala------a-----------
Leifsonia_xyli                    aDREkalv---t------------ala------q-----------
Listeria_monocytogenes            nDRQaald---q------------alk------q-----------
Mannheimia_succiniciproducens     dEKskala---a------------alg------q-----------
Neisseria_gonorrhoeae             dDKskala---a------------ala------q-----------
Nitrosomonas_europaea             eNKnkals---a------------ala------q-----------
Nitrosomonas_eutropha             eNKnkalt---a------------ala------q-----------
Oceanobacillus_iheyensis          sDRKqald---m------------alr------q-----------
Pasteurella_multocida             eNKQkala---a------------alg------q-----------
Photobacterium_profundum          dNKQkala---a------------alg------q-----------
Photorhabdus_luminescens          eNKQkala---a------------alg------q-----------
Proteus_mirabilis                 eNKQkala---a------------alg------q-----------
Pseudomonas_aeruginosa            qaKskale---a------------als------q-----------
Pseudomonas_cepacia               aEKskala---a------------ala------q-----------
Salmonella_typhi                  eNKQkala---a------------alg------q-----------
Shewanella_putrefaciens           pNKEkala---a------------vli------q-----------
Streptomyces_avermitilis          tDREkald---a------------ala------q-----------
Streptomyces_coelicolor           tDREkald---a------------ala------q-----------
Streptomyces_lividans             tDREkald---a------------ala------q-----------
Vibrio_cholerae                   eNKQkala---a------------alg------q-----------
Vibrio_splendidus                 ---------------------------------------------
Vibrio_vulnificus                 eNKQkala---a------------alg------q-----------
Xanthomonas_vasicola              eNKKrala---a------------als------q-----------
Xylella_fastidiosa                eNKKrals---v------------als------q-----------
Yersinia_pestis                   eNKQkala---a------------alg------q-----------
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DEINOCOCCUS_RADIODURANS           ------iek------a---f--gk---g-----------------
Deinococcus_geothermalis          ------iek------a---f--gk---g-----------------
Thermus_aquaticus                 ------iek------e---f--gk---g-----------------
===============================================================================
Consensus                         xdqexxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx

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