140 150 160 170 180 ----|----:----|----:----|----:----|----:----| Consensus xdqexxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx =============================================================================== PYROCOCCUS_FURIOSUS l--------r--e---ag---y-----------------dtleai Pyrococcus_abyssi l--------r--e---ag---f-----------------dtleai =============================================================================== METHANOCOCCUS_VOLTAE ---lve------a----g--yi--d-------------------- Methanococcus_jannaschii ---lke------a----g--yt--d-------------------- =============================================================================== SULFOLOBUS_SOLFATARICUS -vin------k----l--ie---a-----------------gyss Aeropyrum_pernix -taQ------k----l--me---a-----------------gytt Desulfurococcus_amylolyticus -iaD------k----l--ea---a-----------------gyls Sulfolobus_tokodaii -iln------k----l--ie---a-----------------gyss =============================================================================== HUMAN mqmQlean---a------------dts------v----------- YEAST lqEQaeaq---geme---------dea------y----------- Apis_mellifera mastaslq---gdee---------fee------y----------- Aspergillus_fumigatus aDlEtqne---y------------des------g----------- Bombyx_mandarina nttasatt---t------------svd------e----------- Bos_taurus --------------------------------------------- Caenorhabditis_elegans dqallnaa---i------------edn------a----------- Candida_albicans hpQninad---a------------eve------a----------- Candida_glabrata lfhQeqye---egme------------------------------ Canis_lupus mqmQlean---a------------dts------v----------- Coprinus_cinereus qgyDgsqi---p------------egd------e----------- Cricetulus_griseus mqmQlean---a------------dts------v----------- Cryptococcus_neoformans vNQhge------eae---------eed------f----------- Danio_rerio -amrnasr---veve---------aev------e----------- Debaryomyces_hansenii gaQtnehe---a------------smg------d----------- Drosophila_melanogaster -EKltnvq---aqqe---------eee------------------ Drosophila_pseudoobscura ------da---l------------tns------v----------- Emericella_nidulans aDmEtqne---f------------dds------g----------- Encephalitozoon_cuniculi eEyQyq------------------dte------y----------- Eremothecium_gossypii iEvhaesg---r------------gqg------y----------- Gallus_gallus mqvQfeas---t------------dts------a----------- Gibberella_zeae qEhDesqm---g------------eeg------g----------- Kluyveromyces_lactis vqQriqet---dfma---------ee------------------- Mus_musculus mqmQleas---a------------dts------v----------- Neurospora_crassa eEyDesanm--e------------dds------g----------- Nosema_bombycis -----------s------------kqa------f----------- Oikopleura_dioica saEhneag---t------------sen------t----------- Oryctolagus_cuniculus mqmQlean---a------------dts------v----------- Pichia_angusta gEQElsag---y------------hes------mvaedd------ Pleurotus_ostreatus --sQasqd---ldeg---------des------y----------- Rattus_norvegicus mqmQlean---a------------dts------v----------- Schizosaccharomyces_pombe sNyEydvn---v------------qde------e----------- Strongylocentrotus_purpuratus mqmh---n---a------------eqe------v----------- Tetraodon_nigroviridis maaEvrgq---a------------eve------------------ Ustilago_maydis qNaQdpaq---i------------ged------d----------- Xenopus_laevis mqahyeae---a---------------------t----------- Xenopus_tropicalis mqahyeae---a---------------------t----------- Yarrowia_lipolytica --------------------------a------d----------- Cryptosporidium_spp nEivnenn---e------------nqn------n----------- Dictyostelium_discoideum eEvDiene---q------------qqe------e----------- Entamoeba_histolytica vNEEehee---e------------eee------e----------- Leishmania_donovani pqQpqqqq---s------------tdm------a----------- Leishmania_tropica pqQQqqqq---s------------tdm------a----------- Plasmodium_berghei kEdtisqt---c------------dns------t----------- Plasmodium_falciparum kisnssti---deie---------eeq------l----------- Plasmodium_yoelii isQtcdns---t------------ted------v----------- Tetrahymena_thermophila ------ae---y------------aed------v----------- Theileria_annulata lslvkeen---s------------mgv------s----------- Theileria_parva lslvkeen---s------------mgv------s----------- Trypanosoma_brucei dDaavdav---n------------dntqemqqqv----------- Trypanosoma_cruzi eqQQqqqe---d------------qqn------v----------- Arabidopsis_thaliana tmEQrrnq---navq---------qqd------d----------- Oryza_sativa tsaaaaaa---a------------eqq------q----------- Zea_mays asaQqzaa---aaie---------ze------------------- =============================================================================== ECOLI eNKQkala---a------------alg------q----------- MYCOBACTERIUM_SMEGMATIS pDREkale---l------------ama------q----------- MYCOBACTERIUM_TUBERCULOSIS pDREkale---l------------ama------q----------- Acetobacter_polyoxogenes iDKskale---g------------als------q----------- Acinetobacter_calcoaceticus dNKskalq---a------------als------q----------- Actinobacillus_pleuropneumoniae eqKEkala---a------------ala------q----------- Actinobacillus_succinogenes eEKskala---a------------alg------q----------- Bacillus_licheniformis sDRQaald---m------------alk------q----------- Bacillus_subtilis sDRQaald---m------------alk------q----------- Burkholderia_fungorum aEKskala---a------------ala------q----------- Carboxydothermus_hydrogenoformans nDKlkale---l------------tis------q----------- Chromobacterium_violaceum eDKskala---a------------ala------q----------- Clostridium_thermocellum iEKKkale---m------------vlg------q----------- Colwellia_psychrerythraea dDKEkals---a------------ala------q----------- Desulfotalea_psychrophila kDKagsve---n------------ais------q----------- Enterococcus_faecalis dDRKvald---a------------alk------k----------- Erwinia_carotovora eNKQkala---a------------alg------q----------- Haemophilus_ducreyi eqKEkala---a------------ala------q----------- Haemophilus_influenzae eEKQkala---a------------alg------q----------- Histophilus_somni eEKakale---a------------alg------q----------- Kineococcus_radiotolerans aDREkald---a------------ala------a----------- Leifsonia_xyli aDREkalv---t------------ala------q----------- Listeria_monocytogenes nDRQaald---q------------alk------q----------- Mannheimia_succiniciproducens dEKskala---a------------alg------q----------- Neisseria_gonorrhoeae dDKskala---a------------ala------q----------- Nitrosomonas_europaea eNKnkals---a------------ala------q----------- Nitrosomonas_eutropha eNKnkalt---a------------ala------q----------- Oceanobacillus_iheyensis sDRKqald---m------------alr------q----------- Pasteurella_multocida eNKQkala---a------------alg------q----------- Photobacterium_profundum dNKQkala---a------------alg------q----------- Photorhabdus_luminescens eNKQkala---a------------alg------q----------- Proteus_mirabilis eNKQkala---a------------alg------q----------- Pseudomonas_aeruginosa qaKskale---a------------als------q----------- Pseudomonas_cepacia aEKskala---a------------ala------q----------- Salmonella_typhi eNKQkala---a------------alg------q----------- Shewanella_putrefaciens pNKEkala---a------------vli------q----------- Streptomyces_avermitilis tDREkald---a------------ala------q----------- Streptomyces_coelicolor tDREkald---a------------ala------q----------- Streptomyces_lividans tDREkald---a------------ala------q----------- Vibrio_cholerae eNKQkala---a------------alg------q----------- Vibrio_splendidus --------------------------------------------- Vibrio_vulnificus eNKQkala---a------------alg------q----------- Xanthomonas_vasicola eNKKrala---a------------als------q----------- Xylella_fastidiosa eNKKrals---v------------als------q----------- Yersinia_pestis eNKQkala---a------------alg------q----------- =============================================================================== DEINOCOCCUS_RADIODURANS ------iek------a---f--gk---g----------------- Deinococcus_geothermalis ------iek------a---f--gk---g----------------- Thermus_aquaticus ------iek------e---f--gk---g----------------- =============================================================================== Consensus xdqexxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx