190 200 210 220 ----:----|----:----|----:----|----:----|----: Consensus xxeqxxxxxxxxxxxxxxxxxfxxxxxxxxxxgxxxxxxxxxxxx =============================================================================== PYROCOCCUS_FURIOSUS avaspielkevagisegtalkiiqaarkaanlGtfmradeylkkr Pyrococcus_abyssi avaspielkevagisegaalkiiqaarkaanlGtfmradeylkkr =============================================================================== METHANOCOCCUS_VOLTAE --fmkiatatvgeltdiegisekaaakmimgardlcdlgfksgid Methanococcus_jannaschii --fmkiatasigelteidgisekaaariieaarelcnlgfksgte =============================================================================== SULFOLOBUS_SOLFATARICUS letlavaspqdlsvaagiplstaqkiikeardaldirfktalevk Aeropyrum_pernix leaiaaatpqevsqatgipiltaqkivdaarealnidfktaydlk Desulfurococcus_amylolyticus awsivvaraeelaertglpvltvqkiienarkmlgitfktarevk Sulfolobus_tokodaii leavavaspqdlsvaagiplttaqriikearealdirfktalevk =============================================================================== HUMAN -eEE---------s-------F----------Gp------q---p YEAST -dEa---------a-------l----------Gsf-----v---p Apis_mellifera -npQ---------a--------------------------k---l Aspergillus_fumigatus -lpg---------p-------g----------ap------t---p Bombyx_mandarina -dad---------e-------c----------Gp------q---l Bos_taurus --------------------------------------------- Caenorhabditis_elegans -mEQ---------d-------e----------nf------t---v Candida_albicans -eEd---------edvl----n----------Gp------l---l Candida_glabrata -eDa---------a-------l----------asf-----v---p Canis_lupus -eEE---------s-------F----------Gp------q---p Coprinus_cinereus -eDy---------q-------F-s--------Gp------l---l Cricetulus_griseus -eEE---------s-------F----------Gp------q---p Cryptococcus_neoformans -e-----------s-------l----------apm-----l---- Danio_rerio -eEE---------n-------F----------Gp------q---p Debaryomyces_hansenii -eEd---------g-------ls---------Gp------l---l Drosophila_melanogaster -eEg---------p-------l----------------------s Drosophila_pseudoobscura -eEE---------e-------n----------Gp------l---n Emericella_nidulans -lpg---------p-------g----------ap------t---p Encephalitozoon_cuniculi -hsE---------s-------i----------------------s Eremothecium_gossypii -eEd---------v-------a----------la------af-vp Gallus_gallus -eEE---------s-------F----------Gp------e---p Gibberella_zeae -mpg---------p-------g----------ap------t---p Kluyveromyces_lactis -dDv---------a-------l----------aaf-----v---p Mus_musculus -eEE---------s-------F----------Gp------q---p Neurospora_crassa -ipn---------p-------g----------ap------t---p Nosema_bombycis -eEE---------e-------F----------ks------ett-s Oikopleura_dioica -mvg---------a-------i----------hn------d---l Oryctolagus_cuniculus -eEE---------s-------F----------Gp------q---p Pichia_angusta -eDy---------s-------a----------Gp------v---p Pleurotus_ostreatus -q-----------a-------t----------Gpl-----l---- Rattus_norvegicus -eEE---------s-------F----------Gp------q---p Schizosaccharomyces_pombe -dEa---------a-------a----------Gp------m---p Strongylocentrotus_purpuratus -sEE-----------------F----------Gp------l---g Tetraodon_nigroviridis -eEE---------n-------F----------Gp------q---p Ustilago_maydis -mgE---------a-------F----------Gp------l---p Xenopus_laevis -eEE---------n-------F----------Gp------q---a Xenopus_tropicalis -eEE---------n-------F----------Gp------q---a Yarrowia_lipolytica -eEi---------e-------r----------aga-----i---p Cryptosporidium_spp -lnE---------t-------vyn--------Gp------l---k Dictyostelium_discoideum -eEE---------e-------e----------ee------esyls Entamoeba_histolytica -eEE---------e-------n----------aa------v---p Leishmania_donovani -epn---------a-------s----------Gf------r---v Leishmania_tropica -epn---------a-------s----------Gf------r---v Plasmodium_berghei -tEEvdehl----y-------a----------Gp------l---k Plasmodium_falciparum -ytg---------p-------l----------------------k Plasmodium_yoelii -dEh---------l-------Y-t--------Gp------l---k Tetrahymena_thermophila -eQs---------d------------------Gp------m---l Theileria_annulata -esg---------s-------q----------np------q---r Theileria_parva -etg---------s-------q----------np------q---r Trypanosoma_brucei -gDa---------a-------g----------Gpsf----r---v Trypanosoma_cruzi -dga---------n-------n----------Gg-f----r---v Arabidopsis_thaliana -eEt---------q-------h----------Gpf---------p Oryza_sativa -eEg---------e-------h----------Gp------f---p Zea_mays --Ev---------e-------h----------Gpf---------p =============================================================================== ECOLI -iEK---------q-------F----------Gk------g---- MYCOBACTERIUM_SMEGMATIS -iDK---------n-------F----------Gk------g---- MYCOBACTERIUM_TUBERCULOSIS -iEK---------s-------Y----------Gk------g---- Acetobacter_polyoxogenes -iER---------a-------F----------Gk------g---- Acinetobacter_calcoaceticus -iEK---------q-------F----------Gk------n---- Actinobacillus_pleuropneumoniae -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Actinobacillus_succinogenes -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Bacillus_licheniformis -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Bacillus_subtilis -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Burkholderia_fungorum -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Carboxydothermus_hydrogenoformans -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Chromobacterium_violaceum -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Clostridium_thermocellum -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Colwellia_psychrerythraea -iER---------q-------F----------Gk------g---- Desulfotalea_psychrophila -iQK---------q-------F----------Gk------g---- Enterococcus_faecalis -iEK---------n-------F----------Gk------g---- Erwinia_carotovora -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Haemophilus_ducreyi -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Haemophilus_influenzae -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Histophilus_somni -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Kineococcus_radiotolerans -iDK---------n-------F----------Gk------g---- Leifsonia_xyli -iDR---------q-------F----------Gk------g---- Listeria_monocytogenes -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Mannheimia_succiniciproducens -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Neisseria_gonorrhoeae -iEK---------s-------F----------Gk------g---- Nitrosomonas_europaea -iEK---------q-------Y----------Gk------g---- Nitrosomonas_eutropha -iEK---------q-------Y----------Gk------g---- Oceanobacillus_iheyensis -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Pasteurella_multocida -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Photobacterium_profundum -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Photorhabdus_luminescens -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Proteus_mirabilis -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Pseudomonas_aeruginosa -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Pseudomonas_cepacia -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Salmonella_typhi -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Shewanella_putrefaciens -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Streptomyces_avermitilis -iER---------q-------F----------Gk------g---- Streptomyces_coelicolor -iER---------q-------F----------Gk------g---- Streptomyces_lividans -iER---------q-------F----------Gk------g---- Vibrio_cholerae -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Vibrio_splendidus --------------------------------------------- Vibrio_vulnificus -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Xanthomonas_vasicola -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Xylella_fastidiosa -iEK---------q-------F----------Gk------g---- Yersinia_pestis -iEK---------q-------F----------Gk------g---- =============================================================================== DEINOCOCCUS_RADIODURANS -------------------------------------------si Deinococcus_geothermalis -------------------------------------------si Thermus_aquaticus -------------------------------------------av =============================================================================== Consensus xxeqxxxxxxxxxxxxxxxxxfxxxxxxxxxxgxxxxxxxxxxxx