TBP (TATA-binding protein, TF2D)

                                     220       230       240       250       260       270       280
                              ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
Consensus                     xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
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PYRFU                         ----------------------------------------------------------------------
Pyrococcus_abyssi             ----------------------------------------------------------------------
====================================================================================================
HUMAN                         -q-----ap---qlf-------h-s----------q----t---l--tta-plpg----------ttpl-
YEAST                         -k-----pa---ttf-------q-s----------e----e---d--ikr-aape----------sekd-
ARABIDOPSIS_THALIANA          -n-----pv---dls-------k-h----------p----------------------------------
1JFIC_Human                   ----------------------------------------------------------------------
1TBPA_Yeast                   ----------------------------------------------------------------------
Anopheles_gambiae             -ksmhtyap---sfs-------t-p----------q----n---miqpqt-pvsgldlvvsclllksvli
Apis_mellifera                -t-----pq---slm-------q-p----------q----tpqnm--msp-lvqn----------tnhi-
Aspergillus_fumigatus         -t-----paatpgan-------a-p----------g----------------------------------
Bombyx_mandarina              -s-----pa---pmt-------plt----------plsad------------------------------
Bos_taurus                    -q-----tp---qlf-------d-s----------q----p---l--tta-pllg----------ttpl-
Caenorhabditis_briggsae       mv-----pa---tpa-------s-q----------l----------------------------------
Caenorhabditis_elegans        -p-----gs---vmh-------h-nldinppsvayq----n---l--tvp-mtpl----------aysv-
Candida_albicans              -e-----dl---dii-------k-k----------e----d---i--d----------------------
Candida_glabrata              -d-----da---vkp-------e-a----------d----e---d--------------------eded-
Canis_lupus                   -q-----tp---qlf-------h-s----------q----t---l--tta-plpg----------ttpl-
Cryptococcus_neoformans       -s-----kp---egi-------q-t---------------------------ldg----------egsl-
Danio_rerio                   -t-----plyttpltpmtpitpa-t----------pases------------------------------
Debaryomyces_hansenii         -q-----ea---tpk-------k-e----------e----d---t--sdtivepn----------qded-
Drosophila_melanogaster       -t-----pm---tpa-------t-p----------g----------------------------------
Drosophila_pseudoobscura      -t-----pm---tpa-------t-p----------g----------------------------------
Emericella_nidulans           -m-----at---ngq-------s-a----------n----g---n--vng-qqqg----------anaa-
Encephalitozoon_cuniculi      -h-----qe---tsv-------p-n----------r----------------------------------
Eremothecium_gossypii         -h--------------------------------------------------lmg----------gsvv-
Gallus_gallus                 -q-----tp---qlf-------h-s----------q----t---l--tta-plpg----------ttpl-
Gibberella_zeae               -t-----pvatpaat-------q-g----------p----------------------------------
Kluyveromyces_lactis          ----------------------h-e--------------------------slpg----------td---
Magnaporthe_grisea            -q-----rp-------------------------------a---a--nga-pl-g----------sqaa-
Mesocricetus_auratus          -q-----tp---qlf-------h-s----------q----t---l--tta-plpg----------ttpl-
Mus_musculus                  -q-----tp---qlf-------h-s----------q----t---l--tta-plpg----------ttpl-
Neurospora_crassa             -p-----ts---tan-------s-d----------k----s---a--avn-gaig----------aqaa-
Petromyzon_marinus            -t-----pi---tpa-------s-e----------s----------------------------------
Pneumocystis_carinii          -p-----ss---hil-------m-s----------g----a---m--ypg-srde----------kgme-
Rattus_norvegicus             -q-----tp---qlf-------h-s----------q----t---l--tta-plpg----------ttpl-
Schizosaccharomyces_pombe     -q-----as---afm-------n-n----------s----s---l--tfp-vlpn----------ann--
Strongylocentrotus_purpuratus -------tp---s-f-------g-s----------v----g---s--vss-lapg----------ssfi-
Tetraodon_nigroviridis        -t-----pm---tpv-------t-e----------r----------------------------------
Ustilago_maydis               --------------s-------v-h---------------------------------------------
Xenopus_laevis                -q-----tp---qlf-------h-p----------q----t---l--tta-plpg----------ntpl-
Xenopus_tropicalis            -q-----tp---qlf-------h-p----------q----t---l--tta-plpg----------ntpl-
Yarrowia_lipolytica           -f-----pq---da--------e-a----------d----t---s--lig-evkr----------eqvd-
Dictyostelium_discoideum      -q-----nv---dls-------k-h----------p----------------------------------
Tetrahymena_thermophila       -n-----si---dqn-------k-n----------k----------------------------------
Glycine_max                   -q-----pv---dlq-------k-h----------p----------------------------------
Oryza_sativa                  -e-----sa---aal-------e-g----------s----e---p--vdl-a------------------
Zea_mays                      -q-----pv---dls-------k-h----------p----------------------------------
====================================================================================================
Consensus                     xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx

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